车、阿克苏、乌什等城，喀什噶尔守将反正，十月底，南疆各城全收复。明军开始署军伊犁。在明军大的军事压力下，准格尔发生分裂，葛尔丹的侄策妄阿拉布坦率众五千余人逃往冬营地博尔塔拉，并向明军请和罢兵。

昭莫多战后，噶尔丹的境十分困难，即所谓“困穷已极”，“糗粮庐帐皆无，四向已无去路。狼狈不堪，目下掘草为”。但其倔。不肯屈服，最后仰药自尽。最后一代草原狼王，终是不敌千古一帝朱永兴。

昭武三十五年（1696年），沙俄遣使至科布多，抗议明军侵略其境，要求明军撤回。昭武帝当面历数沙俄屡番侵略之实。以及支持怂勇准格尔叛的实迹，严厉谴责其使，并叫嚣要以战争彻底打垮沙俄，哪怕这场战争要持续一百年，也绝不放弃。

同年。黑龙江将军于七率汉蒙联军与另一支哥萨克军在阿里布里亚特再次行激战。在冷兵时代，哥萨克的骑兵以其速度快、机动、杀伤力大、骁勇善战的番攻击令人心惊。但他们纪律差，不愿下作战，更要面对火凶猛，且已经颇有近代化特征的军。失败在所难免，此战过后，沙俄中路侵略的脚步便戛然而止。

昭武三十五年（1696年）秋，昭武帝班师回朝，在蒙古大草原留下的是分散驻扎的两万大军，以及与蒙古诸达成的筑路、设驿站、建商城等援助协议。同年，晋王李定国率大军收复伊犁，完成了统一西北的壮举。而策妄阿拉布坦则成为了准格尔的新主人，迫于明军的大，他改弦更张，积蓄力量，准备向西向北发展，对哈萨克下手。

同年，昭武帝以第桑结嘉对五世**圆寂秘不发丧，以及其和葛尔丹勾结等情况，兴师问罪，调滇、川、楚、浙明军两万，由打箭炉(今康定)兵拉萨，并派礼侍郎陈忠藏协助**汗理政务。同时，封五世班禅罗桑益西为“班禅额尔德尼”。从此，历代班禅均受中央政府册封也成为一项制度。

昭武三十九年（1700年），各省议会相继成立，再度竞选国会议员，组建国会，并于当年秋在北京举行了第一次国会议事。

昭武四十年，大明帝国联合英法两国，兵攻击荷兰在亚洲的占领地，首要目标便是六甲。

前后达二十多年的英荷海上争霸战争，尽荷兰在军事上没有完全输给英国，但从整上说，荷兰海上实力大为削弱了。荷兰在经济、贸易、海运方面的实力大为下降，黄金时代的峰期至1672灾难年就戛然而止。

从1687年法国又重新挑起的一系列斗争（包括陆上威胁、关税战与海上掠夺），把荷兰人的国心消磨殆尽。以致于荷兰被迫放弃自己的仅存的海上军事地位，沦为欧洲二国家，而英国则开始成为海上霸主（分史家把1688年的光荣革命，视为荷兰霸权移给英国的转折）。

但在亚洲，大明帝国则是当之无愧的霸主，不仅陆军可称无敌，连海军亦开始以千吨级战舰作为主力舰。在亚洲，英、法两国也要以低姿态来迎合，以便在亚洲有一立足之地。更重要的是明帝国的主场之利，也就是人优势，能够占领也能够稳固地据有。

面对气势汹汹三国联军，荷兰人稍作抵抗，便让了六甲，中英法三国从而控制了六甲海峡，并签署协定，组建联合舰队打击海盗，维护六甲海峡的航行安全。当然，三国在通行费上也平分秋，各得利益。

昭武四十一年（1702年），第三次国民大议会在北京召开，在昭武帝的推动下，大议会通过了昭武帝自拟的《大明帝国新宪法》。据宪法规定，皇帝仍然是大明帝国的国家元首，但拥有的权力已极为有限。而且，大议会在四分之三多数的支持下就可以弹劾皇帝。

经过四十年的输引导，大量外国科技、文化、历史书籍的翻译发行，新式学校有针对的教育，两代人的思想观念不断改变更新，对于虚君的意义已经有了非常刻的了解。即便如此，中国的大多数民众却表示更愿意在皇帝，也就是昭武帝的统治下生活。