孙文为主，内奉康有为为主，得黄遵宪、陈三立标榜之力，先在湖南省城开讲，抚臣陈宝箴倾言崇奉，专以讪谤朝廷为事，湘民莫不痛恨。今会试，公车骈集，康有为偕其弟康广仁及梁启超来京讲学，将以煽动天下之士心。幸士读书明理，会讲一二次即烛其诈，京官亦知其要，遇有贪鄙者依附之，而唾骂者十居。不知何缘，引内廷。两月以来，变更成法，斥逐老成，借言路之开，以位置党羽，风闻东洋故相伊藤博文即日到京，将专政柄。臣虽得自传闻，然近来传闻之言，其应如响。伊藤果用，即祖宗所传之天下，不啻拱手让人。臣受国恩，不忍缄默，再四思维，惟有仰恳皇太后追溯祖宗缔造之难，俯念臣庶呼吁之切，即日训政，召见大臣，周谘博访，密拿大同会中人分别严办，以正人心，庶皇上仰承懿训，天下可以转危为安。臣愚昧之见，缮折密陈，伏乞皇太后圣鉴。谨奏。”

杨崇伊上奏经过，（徐）凌霄一士随笔中记载甚详，内云：“御史杨崇伊之以危词耸后听政也，折后谒庆亲王奕-，蕲代奏。奕-有难，崇伊曰：此折王爷已见之矣，如日后闹大来，王爷不能诿为不知也。奕-乃诺之，至颐和园见后，面奏崇伊有折言事。后犹作暇豫之状曰：闲着也是闲着，拿过来看看吧。既阅而变，立召见诸大臣。”

杨崇伊字莘伯，江苏常熟人，光绪六年庚辰士，由庶常授编修。光绪廿一年（1895年）授御史，就任后第一疏即于是年十一月首劾康有为、梁启超在北京所创设的学会。结果奉旨查禁。光绪廿二年（1896年）又疏参翰林院侍读学士文廷式革逐回籍。文廷式是光绪的瑾妃和珍妃的老师。照常理而言，杨崇伊发难于先，告变于前，他个人能揣摸慈禧的心理，抓住时机，应该可以从此青云直上。却不料慈禧亲政后他并没有大富大贵。这与袁世凯对比，两人各自有命了。

杨不仅没有飞黄腾达，反而潦倒不堪，光绪卅四年（1908年）八月，以浙江后补丁忧回籍守制，寄寓扬州，竟持枪纠众抢夺女，被江苏布政使瑞-参劾，驱逐回常熟原籍，地方言严加束。

八月初六日的早上，慈禧乘銮舆直光绪寝，把所有文件都拿走。光绪惊惶失措，战战兢兢地跪在太后面前，太后指着光绪恨恨地说：“我抚养你廿余年，你今天竟听信小人之言要谋害我，你还有良心吗？”光绪脸无人，嗫嚅地说：“儿怎敢！”慈禧说：“呸！痴儿，今日没有了我，明天还会有你吗！”

就在这一天，慈禧传旨重行临朝训政，理由是皇帝有病，需要休养。至于光绪皇帝，则被安置在三面环的瀛台中“养病”。

慈禧重掌政权后，立即命步军统领崇礼率兵前往宣武门外的南海会馆捉拿康有为。康已于初五早上离开北京，崇礼只捕到康广仁和康的弟程式毅、钱维骥。又去查抄了张荫桓寓所，把张也捕去。在搜捕康有为时，梁启超正在谭嗣同的寓所，听到了政变的消息，两人相对黯然。谭这时很镇静，慨然对梁说：“在这以前我们一心想救皇上，可是到现在则连救康先生也没有办法了，我现在只好等死，你赶到日本公使馆找伊藤博文，请他通知日本上海领事，设法援救康先生。”梁到日使馆后，外面情形更恶化，他便请日使馆给予政治庇护。谭在家中一直没有事，初七还跑到日使馆去看梁。梁和几个日本友人劝谭逃到日本去，谭说；“变法是大事业，应该血的，中国人还没有为变法过血，我愿以死来答报圣主。”谭在初十被捕，他在监中题了一首绝命诗在墙上：“望门投止思张俭，忍死须臾待杜。我自横刀向天笑，去留肝胆两昆仑。”御史杨秀在政变后竟上疏责问皇帝被废的原因，并反对慈禧训政，于是他便被捕了。初九早上杨锐在床上被捕。林旭是在军机被扣。刘光第、徐致靖则是自己投案。