蜈蚣旗。民国的国旗也不许悬挂，江苏都督府门前大桅杆上挂的是一个斗大的“张”字红旗。所有这些怪现象，袁都装不曾晓得，可是外国使节们对此非常惊讶，他们曾质问南京城不挂民国国旗的原因。袁待外国人抗议了，才打电报责备张勋不该禁止悬挂国旗。

9月17日，南京城内才有五国旗现。

当张勋在南京胡闹时，辫兵烧、杀、抢，无所不为。有一天杀错了人，杀伤了三个日本人，日本全国为之震动，军人们竟向日本外相牧野请愿兵中国。日本驻华公使山座向袁政府提了严重抗议，要求中国政府向日本谢罪，同时黜免张勋。袁派张勋的同乡李盛铎到南京来调查，李劝张对日本人让步，以免引起两国关系恶化。张乃和日本驻南京领事船津直接谈判，谈判的结果是张勋亲自到日本领事馆歉（9月28日），日本放弃了要求撤换张勋的要求。可是日本问题虽告解决，国和英国也一而再提了撤换张勋的要求。由于外国人有这样的要求，正好给袁撤换张勋的好借，何况袁这时在外上正亲英，使他对国和英国的建议愈加认真。10月上旬，他派张勋的老友阮忠枢前来南京，把外团的意见委婉地告诉张勋，要他自动辞职，以免引起外上的更大压力。

张勋正兴采烈他的“两江总督”，听了阮忠枢的话，直气得一佛世，二佛升天，跺着脚说：“我的这个印把，是拿自己的命拼来的，袁保要怎办就怎办，用不着拿洋人来吓唬我，也用不着劳你的大驾来劝我。”阮败兴而归，把张的一切回报了袁。袁对这位张辫帅也有伤脑，又派李盛铎、刘恩源、钱能训、段芝贵陆续前往南京劝张，接受新命——长江巡阅使。段芝贵最长辞令，他说：“总统确有苦衷，不愿意惹起外上困难。”然后他传达袁的意旨，请张改任长江巡阅使，他描绘巡阅使在官职上是比都督大一级，都督只一省的军事，而巡阅使却好几省的军事。

张果然动心了，同时他也没有能力敢于抗命，于是提了三个调职条件：一是他在江苏都督任内开支的65万元准予报销；二是调职后请再拨开费50万元；三是他奉调长江巡阅使必需有实际的权力，要节制湖南、湖北、江西、安徽、江苏五省的上警察。

段芝贵把张勋的条件回报给袁，袁毫不考虑便全接受。12月16日，袁发表了新的人事命令，调张勋为长江巡阅使，任命冯国璋为江苏都督。巡阅使这个官位，在袁最初的意思，也同于屯垦使、检查使之类，徒有空名的大衔，怎知张勋手中有兵，又预约了条件就职，于是巡阅使这个官位后来竟成为凌驾都督之上，割据数省的大军阀。

在二次革命期间，浙江都督朱瑞是中立的。朱瑞，字介人，武昌起义后，他是清军协统，领导浙军，参加江浙联军攻打南京，负责攻紫金山，因为没有大炮，所以攻打不下。沪军都督陈英士的参谋丁怀瑾率领沪军先锋队助攻，特自上海讨来炮兵一队，并使用江边炮台，发炮三枚城，目标地是城内北极阁，恰遇两江总督张人俊、提督张勋及各司在北极阁会议，闻炮声骇散，不二日，员江某和英领事奉命悬白旗向革命军要求停战，南京遂告光复。丁怀瑾有诗纪事，中有句云：“两张（即张人俊和张勋）心胆应惊碎，一炮声威避难。”

民国成立，朱瑞任浙江都督，二次革命时，朱瑞和云南都督蔡锷都是宣告中立的。